Il y a huit organisations qui composent le Secrétariat exécutif du FSM. Le bureau se situe à São Paulo (Brésil), il est responsable de la coordination de la dynamique.
Il est formé par les huit organisations qui ont été membre organisateurs en 2001 :

   Si le Forum est organisé en dehors du Brésil, un Comité organisateur spécifique au pays est formé puis entre dans le Secrétariat exécutif.